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分子进化与生态
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张金龙的博客

进化生态学的原理与数据分析

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2010年3月

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标题：天文计算PyEphem指南

浏览：255 评论：0

天文计算PyEphem指南作者 mrstarlitskyjinlongzhang01@gmail.comPyEphem是Python下的一个软件包，可以给出专业水平的星历表计算，可以用来计算不同坐标系下太阳、月亮、行星、彗星及人造卫星的位置，亮度，出没时刻，中天时刻等等。为天文爱好者制作星历表提供和方便。但是初次接触该软件可能觉得无从下手，本文做简要介绍。一下载和安装软件下载Python...

本文引用地址：http://www.sciencenet.cn/blog/user_content.aspx?id=287895

标题：在Ubuntu Linux中安装R

浏览：386 评论：0

在Ubuntu Linux里安装R软件1 在终端输入 sudo gedit /etc/apt/sources.list file打开软件源文件将 deb http://ftp.ctex.org/mirrors/CRAN/bin/linux/ubuntu karmic/拷贝到该文件中。2 输入 sudo apt-get update sudo apt-get install r-base...

本文引用地址：http://www.sciencenet.cn/blog/user_content.aspx?id=284027

标题：在Ubuntu Linux编译r8s

浏览：326 评论：0

r8s是校对分子钟的著名软件，在分子进化领域有着广泛的应用，但是作者提供的可执行文件只有Mac版本，作者也提供了该程序的源代码，使得用户可在linux下对其源代码进行编译，从而使运行成为可能，下面就讲述一下，如何在Ubuntu Linux系统下编译该软件的源代码。在Ubuntu Linux编译r8s源代码1 将r8s压缩包下载到本地，如存放在 “下载” 文件夹中原代码网址...

本文引用地址：http://www.sciencenet.cn/blog/user_content.aspx?id=284016

标题：统计结果的保存：Sweave in R

浏览：623 评论：0

Sweave in R?Sweave是R中的一个函数，用来生成统计报告的。如果你希望将R的代码和LaTeX的代码整合到一个文件中，可以用Sweave函数生成.tex文件，利用安装好的LaTeX编译TeX文件就能生成包含相应计算结果的pdf文件。Sweave处理的是.Snw文件，其格式几乎与.TeX文件相同，不同的是，其中的R代码包含在<<>>= 和 @ 之间，其中<<>>内部可以放置Sweave...

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标题：如何在windows中编写R程序包

浏览：659 评论：0

如何在windows中编写R程序包 helixcn在Windows环境下如何编写R程序包，即生成供linux环境编译运行的tar.gz文件，也生成供windows下使用的.zip文件呢？其实并不复杂，只要下载一些工具软件，按照相应的步骤填写相应的“表格”，继而运行一些简单的指令，就可以生成R的程序包了。编写R程序包通常包括以下几步：（1）工具软件Rt...

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标题：生物多样性与宏生态学链接

浏览：750 评论：0

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标题：从现在开始学习R

浏览：679 评论：0

R作为一种统计与语言，具有灵活的数据处理能力和强大的作图功能。用R语言能够得到做到的精美的图形，做出的统计结果，很多是SPSS无法用简单的界面操作难以完成的。如矩阵操作，GAM。有人说SPSS界面化操作，简单易学，当前的教程很多。界面化操作除了容易入门之外，其计算过程过于拘谨，如果要将相似的内容重复很多次，界面化操作的统计平台无疑是对人的摧残。而用程序代码执行类似的操作，仅需要将相应的代码做小...

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标题：R语言：常用统计检验-续

浏览：973 评论：1

理论分布依赖于若干未知参数时 Kolmogorov-Smirnov 检验 ks.test() 例一对一台设备进行寿命检验，记录十次无故障操作时间，并按从小到大的次序排列如下，用ks检验方法检验此设备无故障工作时间是否符合rambda=1/1500的指数分布命令： X<-c(420, 500, 920, 1380, 1510, 1650, 1760, 2100, 2300, 2350) ks...

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