畜禽养殖业具有保障食物安全和减少农村贫困的功能，在我国被作为农村经济结构调整的主导产业予以重视。但是，畜禽养殖废弃物诸如粪便、污水、粉尘、恶臭、噪音等，会对农村大气、水体、土壤、生物各圈层造成交叉复合影响，甚至对生物多样性下降、全球气候变暖都有一定贡献率。在我国，畜禽养殖污染已成为农业面源污染的主要来源，各种规模化养殖污染事件在近年频频发生。比如，2005年四川仁寿县猪粪污染水源致使七千人停水六天，引起了社会广泛关注。畜禽养殖业的经济功能与环境影响之间的这种矛盾，要求政府从技术和政策两个层面上付诸努力。

        在我国，农村沼气技术是防治畜禽养殖污染的主要技术手段。政府为了促进其推广应用，制定了许多经济激励政策。比如，中央财政在2001年设立安排了农村小型公益设施建设补助资金农村能源项目，对沼气池建设给予一定的资金补贴；在2003年又专门设立了农村沼气建设国债项目，对以沼气池建设与改厕、改圈、改厨为基本单元的农村沼气项目进行补贴。那么，这些经济激励手段是否实现了预期政策目标？我们的前期调查表明，即使沼气建造补贴具有广泛获得性，仍然有许多农户不愿意建造沼气池。显然，付出了巨大的公共财政资源却没有收到令人满意的效果。这是出于农户方面问题，还是政策执行问题，抑或是来自沼气技术的原因？

        政策制定者很少对畜禽业发展和环境保护两方面给予综合考虑。2007年，由于饲料成本上升等原因致使内地部分省份猪肉价格大幅度提高，政府为了增栏稳价而制定了生猪养殖补贴等各种鼓励规模化养殖的政策。而在同期，广东东莞市却为了保护环境做出了禁止养猪并将禁养家禽的规定。那么，这些鼓励养殖政策是否会造成更严重的环境污染问题，那些保护环境的禁养政策是否会导致更趋紧张的肉产品供应？农业部在2006年启动了畜牧水产业增长方式转变行动和生态家园富民行动，推行健康养殖方式，试图发展一种环境友好的畜牧业生产方式。但至目前，全国尚没有出现相当成功的健康养殖小区。

        总之，无论是沼气促进政策，或是畜禽产业促进政策，或是污染治理政策，这些政策都没有很好地实现畜禽业发展与环境保护的一体化发展。可以预见，在消费者收入增长和消费结构升级的压力下，畜禽养殖将更趋规模化，畜禽污染将进一步加剧。因此，加强沼气技术应用于畜禽污染防治的公共政策研究，检验政府在过去几年所执行政策的效率，对于我国畜禽业发展和农村环境治理具有显著的紧迫性和必要性。