与实验室秘书大姐的一次谈话

2010-09-07 04:50

上周末离开SUNY Upstate，太太陪我一起开车到了芝加哥。虽然决定离开不是一件容易的事情，但到了离开的时候，导师还是打起精神，举办了一场Bye-bye Party。实验室的人都去了，除了实验室的秘书大姐。她和她的男朋友开车到New York city去看纽约洋基队的比赛。她的男朋友是洋基队的铁杆球迷，有些比赛，譬如与波士顿红袜队的比赛，是必看的。

秘书大姐年龄约50多岁，是导师到了SUNY Upstate以后与另两个老板共同雇佣的。她的主要任务是处理一些与人事、基金、论文润色等有关的杂务。她整天笑眯眯的，大家都很喜欢她。

因为她没能参加我的欢送会，她跟我说抱歉。我说没关系，洋基队赢了就好，我请你吃午饭（当然是AA制那种）。她欣然接受邀请（她还挺给我面子的）。

她虽然来实验室大半年了，但都是各干各的事情，基本没有聊过工作以外的事情。与她吃一顿饭，让我对她有了更多的认识。她在来我们实验室工作以前，失业了半年。之前为纽约州政府工作了12年，主要做与各种选举有关的工作。由于经济危机，纽约州政府与工会谈判，给两个选择：员工集体降工资，或者裁员130多人。工会选择了后者，而秘书大姐不幸在其中之列。

科学网的那些好友们，你们都还好吗？

2010-08-28 13:05

测试顺带打听一下我的好友列表里的几位：

1）孙尉翔。我把他加为好友，但他却拽得很，不让别人留言。曾几何时，他的博客上不去了。他的观点的穿透力很令我开眼界，也让我找到了“年轻人在XX进程中有冲刷力”的一个例子。科学网有好玩的，也有不好玩的，祝愿他一路走好。

2）柳东阳。专心搞学术就对了，尤其在关节点上。科学网就相当于集市，一个星期来科网遛二三十分钟，调节调节，也未尝不可。说不定，一不小心，还搞到一两件有用的东西呢。

3）陈洪波。先是写得越来越少，然后几乎不写了。科学网上敢于写自己真实感受的人比较少。因为这很难。

4）小丛。有些日子没写博文了。对于别人来说，再正常不过了，但对于你来说，有点异常。适当戒网会有好处。在中国接受教育并工作过的炸药奖获得者就说他从不上网。也许正因为如此，他的作品才每部都不一样。

从研究生工资想起朱清时校长

2010-08-15 07:43

最近科学网热议研究生待遇问题。有人把中国的状况和美国相比。这确实没有可比性。在美国，有工作的人就是中产阶级，有房有车。研究生的收入显然在中产阶级以下，是穷人，所以通常有车没房。但中国的情况就有些特殊，穷人的比例很大，中产阶级比例很小。研究生说自己穷，导师可以给出两个强有力的理由：第一，中国比你穷的人还有不少；第二，美国学生都是穷人阶层，凭什么你们要在中国成为“不穷人阶层”？但这两个理由脱离了实际情况，实在是强词夺理。具体我不分析了，相信以科学网读者的智商，都知道是怎么回事儿。

导师也有很多苦衷。研究生待遇如何，不是导师能决定的。按照中国的规矩，研究生要涨工资，得找领导，找政府。

我的运气比较好，在十年前刚读研究生的时候，没有找领导，也没有找政府，工资就自动从270块涨到了650块，转博以后，成了800（850？）块。在那时的合肥，270块刚好能填饱肚子，650块可有空就出去下下馆子，800块就可以请客吃饭了。如果运气好的话，在博士期间结婚，还可以分得一套带洗手间的标准间。也很不错。

成“家”，先成“人”

2010-08-14 23:22

吕乃基老师的《中国有“5位”经济学家吗？》提出的问题有点猛，想借此余波，发挥一下。“家”有很多：政治家、思想家、文学家、历史学家、哲学家、自然科学家、经济学家。。。理论上，要成为“家”，就得先成为一个真正独立的人。这种人可以摆脱主义、权力和利益包夹，拥有自由独立的学术思想。如果连“人”都做不了，就别谈“家”了。

“家”的这个前提条件对于自然科学家来说，似乎不是必要的。自然科学家更多是以其研究成果来定义。所以历史上，不乏具有强烈小偷和强盗特性的著名自然科学家。他们的这些污点往往可以被他们在科学上的重大贡献而淡化。

可能正是因为如此，在一个文明程度较高的国家里，自然科学工作者（含自然科学家）是社会的重要组成部分，但与其他“家”相比，自然科学家很少可以成为社会的号角和旗帜。

长链非编码RNA

2010-08-08 08:32

有些时间没聊科学了，就谈一篇刚在《细胞》杂志发表的论文吧。http://www.cell.com/abstract/S0092-8674%2810%2900730-0

这篇文章研究长链非编码RNA（long/large noncoding RNA）。最被人熟悉的RNA是mRNA，它负责把DNA信息转化为蛋白质，也被称为编码RNA。除此以外的，就是非编码RNA，例如rRNA, tRNA, snRNA, microRNA，它们在蛋白合成、RNA剪切、mRNA降解等重要生物学过程中起重要作用。相比之下，长链非编码RNA的研究就比较少，但最近有升温的迹象。

这篇文章的出发点是研究P53对“基因间的长链非编码RNA”（large intergenic noncoding RNA，简称lincRNA）的调节。P53基因调节细胞的很多生理学过程，包括细胞凋亡。P53突变在肿瘤中的出现频率非常高，所以也是被热门研究的蛋白。P53是一个转录因子。在这篇文章，作者发现P53可以直接提高一个lincRNA（lincRNA-P21）的含量，然后lincRNA-P21与蛋白hnRNP-K结合，再调节其他基因的表达（如下图）。

20万大洋！

2010-08-08 08:26

今天一觉醒来，发现自己博客的点击数到了20万！谢谢各位乡亲父老、兄弟姐妹的热情支持！啪啪啪啪啪啪！

常常觉得自己很忙

科学网也可以让我偷着乐

科学网吓我两跳的两个地方

2010-08-03 10:37

一跳

* 本文仅代表博主个人观点，与科学网无关。

二跳

请注意使用文明用语

同时

也让我想起了《疯狂的石头》里的老大的一句经典台词，而且，把那句台词颠倒一下次序，更合适。谁能说出我想的那句台词，有奖！

*****************

公布中奖者第一名：

[1] 标题：发表评论人：QFL [2010-8-3 10:43:45] 删除回复你侮辱我的人格，你还侮辱我的智商!
博主回复：您太厉害了！看来我是白混了。
至于奖品嘛，发短信息给俺。咱私下谈。

建议科学网在首页进行分区

2010-07-31 10:56

在科学网混了一年半了。在这里欣赏了很多有思想的博文，看到了一些自己从来没想到的见解，当然，少不了的，是学习了新的知识，见识了不同类型的博主。但科学网也有混乱的时候，有令人费解的地方，当然，其后果是，有些我很期待的博主封博或者休眠了。

我觉得，科学网的一个令人不舒服的地方是把所有博文混在一起，类似于一锅大杂烩，把各种材料往里扔，各种作料往里加，不按菜谱来调配，以至于做出来的菜令大多数人都皱眉头。我认为，解决的办法也可以很简单，只要在首页进行分区，排出：专业学术区、科普区、诗词文学区、科技绯闻区、科技政策区、大仙区（民科）、掐架区。。。（还可以由更多）

按星爷的话说：主角留给我，杂碎到那边。进入一个自己喜欢的区，不会让自己觉得碍眼，也不会出现“明明想吃甜的却吃了醋”的难堪。同时，也可能把一个人的多面性分开。例如，一个人在掐架区可以是个恶人，但在专业学术区可以是个才华横溢的人才。

来美国读本科的中国学生激增

2010-07-29 11:39

前天和太太聊天，提到一位同事的孩子被美国一所不错的公立大学录取，攻读本科学位。她顺带说了一句，那所大学同时还录取了200多位来自中国的学生。

04年刚来美国时，在学校碰见的中国人基本为研究生或博士后。最近两三年，自己也确实能感觉到周围的年轻中国面孔多了很多。不用说在校园里，在地铁、超市或其他公共场所，也经常能碰上。

看了一下网上的信息，证实了来美国读本科的中国学生（本科和高中）确实在近年剧烈增加：

http://blog.sina.com.cn/s/blog_6408221c0100hd0w.html

http://www.zmnedu.com/news/visa/1306.html

这个现象反映了中国人在某种程度上实现了从“到外地谋机会”到“出钱到外地谋教育”的转变。我想这里的原因很复杂，有令国人欣慰的，也有令国人担忧的。

我的Hotmail 被黑了

2010-07-22 00:41

今天早上8点，我正在上班的路上，有朋友打电话给我，说收到一封邮件，里面说我在马来西亚，需要钱，让大家把钱汇到当地地址。用的是我的hotmail信箱。我一听，觉得不妙：莫非有人盗用了我的hotmail信箱？到实验室，不幸的事情果然发生了，我的hotmail信箱秘密被别人修改了，我的hotmail被黑了！msn messenger不能上！facebook也不能上！

自己的hotmail信箱也在科学网上，还有几位科学网的朋友也用hotmail与我联系。他们也应该受收到这诈骗封信了。打开科学网一看，果然有人留言给我说了这个问题。谢谢关心，我也这里再澄清一下。

目前正在努力寻求解决办法。

我不知道有多少人遇到过这种事情。Email对我们来说越来越重要，但它的保密性和重要性却很容易被忽略，直到被攻击了，才让我知道有很多隐患，搞不好，会带来严重后果。

教授写书

2010-07-18 06:11

前些日子与孔晓飞兄私下交谈的时候，他说正在读一本书，是关于动物发育进化的，作者是Sean Carroll。我没有看过那本书，但对Sean Carroll倒是有些认识，原因之一是他的实验室也研究果蝇。按照科学网读者的标准来看，他肯定是“牛人”了：CNS文章一大把，HHMI研究员，美国科学院院士。好像就只差一个炸药奖了。

在九十年代和00年代初期，Sean Carroll主要研究homeobox gene对果蝇肢体和躯干发育的调节。可以说，这方面的工作是他成为HHMI研究员和院士的资本。在最近几年，他的研究兴趣转到了动物进化上，研究基因调节对动物新性状产生的影响。在基因转录调节中，增强子（enhancer，是一段DNA序列）起重要作用。Sean Carroll的研究结果表明，增强子上的突变对果蝇新性状的形成起重要作用。对于纯进化的文章，我不是太感兴趣，欣赏水平也不够。读过几篇Sean Carroll近期发表的文章，感觉没做什么东西，却也发表在Nature 或Cell上。

聊聊培根和笛卡尔---写在鬼王可能回归之前

2010-07-11 11:24

前天有幸在搜狐短消息信箱里和鬼王聊了一下。就这一下，他在我的信箱里留下了30页的短消息。与此相比，我写得很少，以看为主。

最近半年，我常看鬼王的东西，但通常很难看得完。可能是他写作的风格和呈现出来的思维方式与我的相差太远，以至于我根本就不知道他想说什么。即使在短消息里交流，我还是很难理解他所说的某些东西。请允许我摘几句话：

“生命的核心就是不听话；你搞定了，听话的东西，就叫计算机，不叫生命。”

“科学深入了，不是看其客观性了，只能是由主观的特殊和一般决定。”

“全部的规律,都起源于无规律，这样的规律才是最可靠的。”

“我搞了这么久,越来越感觉到：我说过几次,就是一刀，一刀切出整个世界。尘归尘，土归土。”

“认知的底层是承认则各不可知的东西。单元绝对自由，是真随机。”

关于施饶教授话题在科学网引起的起哄---兼答吴国胜兄

2010-07-04 20:25

昨晚在吴国胜博主的博文《请善待科学网的弱势群体》留言，认为施饶两位教授谈的有些话题在科学网引起起哄是正常的。吴兄可能太激动，一下子就给我扣上了“起哄者”的帽子。其实我还真的没有想过要写起哄的博文。我有一次问饶海教授：您在现实生活中也像您的博文一样“搞怪”吗？他说：不是的，只不过我懒得在科学网上和别人争论问题，所以就采取了这种风格。我却做不到他的境界。既然吴兄提起，我就谈一谈自己的看法。

施饶两位教授是著名华人科学家，这一点谁也不可否认。在科学网上开博，而且坚持写博的著名华人科学家也有一些，如何毓琦、孟津、鲁白等。这几位博主写的话题多是与生活和科研的细节有关，所以他们的博客都显得很风平浪静。施饶两位教授则谈了更多国家的科技政策和未来中国科学发展取向的问题。这些问题很敏感，因为牵涉到了多方面的利益，引来一片反对嘲笑之声是很正常的。也就是说，他们谈的问题带有比较浓厚的“政治色彩”。争论政治问题，是一个稍微具有民主的国家的特征。不争论政治问题的国家，估计这个地球上就只有北朝鲜了。所以，任何谈国家政策的话题，都会，而且也因该在科学网引起很多争论。当然，如果争论变成了人身攻击，恶意中伤，抹黑人格，就太过了。既然是实名网络，网民就应该为自己说过的话负责。科学网应备份所有的留言评论，说不定在法庭上还用得上。

值得一看的一本书（尤其是生物背景的同学）

2010-07-04 10:19

今天在搜索一些东西时，无意发现了这一本1988年出版的书《Natural obsessions》。描写当时的两个研究癌症的实验室的研究突破、遇到的困难、犯的错误、以及导师博士后学生的一些研究生活细节。其中的一个实验室是MIT的Robert Weinberg，他现在依然是最活跃的癌症研究者之一。我通过以下这个链接看到书的部分内容：http://books.google.com/books?id=4hK1GO3VFkwC&pg=PA357&lpg=PA357&dq=Weinberg+wrong+retinoblastoma&source=bl&ots=Jz2FbqsYK2&sig=YqzbXoB3pjvnhlOZPmaL9AbHblk&hl=en&ei=_sAvTJuUDcH-8AbEmZm2Aw&sa=X&oi=book_result&ct=result&resnum=1&ved=0CBIQ6AEwAA#v=onepage&q=Weinberg%20wrong%20retinoblastoma&f=false

周末娱乐版：世界杯

2010-07-03 12:33

不经不觉，来美国的时间已经跨越了两届世界杯。如果当初不是老爸认为踢球危险，说不定我和哥哥都能玩几下。老爸也算是一个关心国足的人。但中国类似于他的伪球迷太多，这应该是中国足球不能崛起的原因之一。如果他当初跟我们说“想做男人，就得踢足球！”“踢断了一条腿没关系，只要还有另外一条腿，就得继续踢！”，那么，我和哥哥即使成不了职业球员，也可以成职业球迷啊。没有怪他老人家的意思。因为中国不但没有踢球的思想，踢球的场地也没有。还是打乒乓球好一点。

来了美国以后，逐渐把足球淡化了。如果不是根据以前的知识积累，真的很难发现美国也有足球联赛。在波士顿还好一点，那里有一支新英格兰革命者队，经常能进入联盟的总决赛，所以在体育节目里还能一年露两三下脸。最有意思的是2006年世界杯，美国首场比赛0:4惨败，主持人在讲完了棒球、篮球和体坛花边新闻以后，来了一句：“世界上有一种运动，叫足球，但美国人玩得并不怎样。”

让我们的国家成为一个适合人类生存的地方---再谈乡村教育

2010-07-01 09:30

前段时间写了几篇博文，谈了自己对家乡教育的一些想法，甚至还计划做一些具体的事情。但由于没有得到足够的支持，自己也是处于忙碌谋生的状态，就只好暂时搁置。这也让我知道做一件事实的不容易。如果不是用心去做，基本没有成功的可能。不过这过程中也让我积累了一些认识和教训，相信不久以后会用得上。

刚才收到周国军兄的短消息，与我谈了一些乡村教育的事情以及个人打算。周兄对于乡村教育，有丰富的实战经历，所以他的博文应该更能反映出中国乡村教育面临的严峻形势。此外，柳东阳、苗元华和陈洪波也深刻地谈过或正在谈中国农村或农村教育的现象和问题。虽然谈这些问题通常不会有什么用，但我还是很欣赏在科学网谈此类问题的人。所以，我在给周兄的短消息中说了一句：“想中国朝好的方向发展，中国的老百姓就应该有站出来谈自己感受，谈个人看法的勇气，即使明知道作用是微乎其微的。”

相当一部分政府官员认为，引进人才是中国发展的动力源泉，或说是希望所在。这种观点基本是一种误导。好的人才是不能引进（引诱使之进入）的，只能吸引。若不然，即使人才真的来了，也只是抱着试试看的心态。吸引人才的一个关键条件是可持续发展的环境。而一个可持续发展的国家要必须要有一个可以为多数人民谋福利的政府。如果我们的政府能做到这一点，华人固然会挤破了头海龟，五颜六色的人种也会往中国涌。人才随便挑。

关注细胞内的泡泡

2010-06-27 22:05

最近一期《Cell》发表了一篇关于presenillin-1与老年痴呆症的文章（http://www.cell.com/retrieve/pii/S0092867410005441 ）。如果光看这一句话，大家就会很诧异：presenillin-1突变会造成老年痴呆症已经是老早就知道的事实，怎么这样的工作还能发在《Cell》上？

presenillin-1是γ-secretase的一个必不可少的亚基，而γ-secretase的一个重要功能是切割膜蛋白APP。以前的观点认为，presenillin-1突变以后，APP会被非正常切割，从而产生有神经毒性的底物Aβ肽。Aβ肽的积聚令神经元坏死，继而导致了老年痴呆症。

此外，以前的研究还发现，Aβ肽产生以后，神经元需要动用内吞噬系统（Autophagy），把Aβ肽包入自吞噬体（Autophagosome）中，自吞噬体再把包含物传递给溶酶体（Lysosome），最终降解Aβ肽，缓解其毒性。如果自吞噬系统出了问题，降解Aβ肽的能力下降，那老年痴呆症的病情将进一步恶化。自吞噬体和溶酶体都属于细胞内的囊泡系统（Vesicle），通过细胞内膜把包含物和细胞质分开。

四万亿救市，让人民的命运更好地被掌控在政府、银行和房地产商的手里

2010-06-25 12:21

刚才和一位在银行工作的同学聊天后，从他那里得到的一些见解。不知大伙是否同意？

我的博士后生活（下）

2010-06-14 01:16

继续。写之前，聊聊别的。从陈儒军兄那里知道吴飞鹏老师把博客打扫干净，走了《震撼与呼唤！评名博吴飞鹏老师删除全部博文》。吴老师的博文我还是挺喜欢的。他在博客中表达的大概意思是：希望唤醒我们的这个科研体系和既得利益者对年轻人命运的重视。可能他觉得在科学网上喊这个东西根本不work out，就拍拍屁股走人了。革命歌曲告诉我们，这个世界根本就没什么救世主，年轻人啊，只能靠自己找出路了。

没想到上一篇博文会那么受欢迎。除了这一篇，我的另一篇受欢迎的博文是《到公司工作还是在学校工作？》。这有点意外，但一想，也是合情理的。这一类博文从题目上看，年轻人觉得可能有用，自然就会点开来看看。所以我还是必须兑现诺言，把下部分写完。五年多的博士后历程，有点长，我就按时间顺序来，分几部分简述。

科研

（非生物学专业的读者可以略过这一部分。我的研究简史大概是：开始顺利，中间遇到很多麻烦，最近又有些转机。）

我的博士后生活（上）

2010-06-10 11:53

开这个博客，是希望和年轻人分享一下做科研的酸甜苦辣。介绍一些有趣的科学问题和科研成果，是很令人赏心悦目的事情，但谈到自己的科研状况或将来的打算，难免会觉得苦远多于甜。不过这也应该是正常现象，毕竟科研是以失败为主的，至少我认为生命科学研究是如此。

在科学网谈自己的个人感受，是很不容易的事情，尤其是对于一个革命尚未成果的人来说。关于这一点，我很赞赏科学网的马臻和盖鑫磊博主，他们谈了很多青年科学工作者的真实感受。正面的东西对于后来人起鼓励作用，但一些经验教训更能令后来人受益。

对于如何做科研、写文章、申请博士后、申请教职，除了马臻和盖鑫磊，饶海教授也谈了不少他的亲身经历（虽然他的大部分博文是以搞怪为主），我在这里就简述一下。

我在国内拿的博士学位。虽然期间在科研上遇到一些技术上和思路上的困难，但总的来说还算顺利。五年如期毕业，也发了几篇第一作者文章。在毕业前一年的年底开始联系博士后。我当时（2004年）认为中国生命科学的科研水平和美国的差别非常大，而且可以通过做博士后来换一下研究方向，扩展自己的视野，同时也可以再次检验一下自己的科研能力，所以就只选了来美国做博士后这一条路。联系了大概二十个实验室。这些实验室主要分三种：与自己博士期间做的工作有点关系的、自己感兴趣的、以及登广告招人而且觉得自己背景合适的。有两个实验室对我很感兴趣，表达出了强烈邀请我的意思，他们所做的方向与我博士期间的方向相近。另外有五个实验室索取了推荐信，让我等消息。最后总共有五个实验室给我offer。

科学网博客——张天翼的博客